Stanovení genetického profilu znamená stanovení souboru vlastností, které jsou pro daného jedince charakteristické a nenahraditelné (například jako otisky prstů). Jednotlivec může být jednoznačně identifikován na základě jeho genetického profilu. Genetický profil psa lze použít v následujících případech:
1) Ztráta, krádež
Genetický profil psa umožňuje jednoznačné prokázání totožnosti v případě nalezení ztraceného nebo odcizeného psa.
2) Identifikace na celý život
Pokud přestane fungovat mikročip, kterým je pes vybaven, můžete prokázat totožnost psa a nainstalovat nový čip.
3) Testování otcovství nebo mateřství
Genetický profil je nezbytný pro testování vztahu jedinců, zejména pro testování otcovství nebo mateřství.
4) Inseminace
Často je nutné zjistit genetický profil chovných psů, jejichž sperma je uložena a následně použita k inseminaci. Genetický profil jednoznačně identifikuje spermie a lze jej použít k testování otcovství.
5) Zkontrolujte, zda není „vymazáno rodiči“
U plemen, která jsou postižena konkrétní recesivní genetickou vadou, bývá zvykem testovat vybraný rodičovský pár na absenci této vady. Pokud jsou rodiče zdraví, pak je téměř 100% jistota, že potomek bude zdravý (pravděpodobnost vzniku nových mutací je asi zlomek procenta).
Někdy se noví majitelé štěňat chtějí ujistit, že vybrané štěně není ohroženo určitou vadou. To lze potvrdit přímým testem na tuto genetickou vadu nebo potvrzením otcovství a mateřství – štěně je potomkem deklarovaných rodičů, kteří tuto genetickou vadu nemají.
Doporučujeme, aby si při nákupu štěňat, u kterých je uvedeno „od rodičů jasné“ nebo „rodiče normální“, zkontrolovali otcovství a mateřství. Toto opatření je prevencí podvodů či jiného nečestného jednání školky.
Při výběru optimálního chovného páru se posuzuje řada atributů – povaha, vzhled, zdraví atd. Genetický profil lze použít jako další nástroj, který vám pomůže učinit správné rozhodnutí. Pokud chceme do chovné linie přivést novou krev, je vhodné porovnat genetické profily potenciálních rodičů. Je žádoucí, aby chovný pár byl heterozygotní (odlišný) v maximální možné míře pro srovnávané znaky. Platí, že čím více odlišných vlastností jedinci mají, tím méně si jsou geneticky podobní.
Porovnání genetických profilů chovných jedinců nám umožňuje dosáhnout maximální genetické diverzity v rámci plemene a zachovat požadované fyzické a psychické vlastnosti plemene.
Co je to genetický profil?
Stanovení genetického profilu znamená identifikaci souboru genetických znaků, které jsou pro daného jedince charakteristické a nenahraditelné (například otisky prstů). Na základě genetického profilu lze jedince jednoznačně identifikovat.
K určení genetického profilu se používají krátké tandemové repetice (STR). Tyto repetice, také nazývané mikrosatelity, jsou třídou genetických markerů sestávajících z tandemových repetic sekvencí o velikosti od dvou do sedmi párů bází. Alely STR lokusu se liší v závislosti na počtu repetic daného monomeru. Díky své vysoké úrovni polymorfismu (informativnosti) a mendelejevské dědičnosti se mikrosatelity staly vhodnými genetickými markery pro studium genetické diverzity, testování příbuznosti a přímou identifikaci.
Alely STR jsou určeny pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR-polymerázová řetězová reakce). Jeden z primerů každého páru na 5. konci je označen fluorescenčním barvivem. Separace a stanovení fragmentů se provádí během jednoho elektroforetického efektu pomocí automatického elektroforetického zařízení.
Z hlediska testování profilu jsou možné dva hlavní přístupy:
markery podle ISAG – mezinárodní společnosti živočišné genetiky
AKC markery – American Kennel Club
Tyto dva přístupy se v klíčových ohledech liší v markerech, které detekují, takže výsledky testování prováděného pomocí těchto dvou přístupů nejsou vzájemně kompatibilní. Pokud má například jeden z rodičů genetický profil určený AKC a potomek ISAG, nelze vztah určit porovnáním výsledku. Naopak, pokud jsou oba geneticky profilovány pomocí stejného přístupu, lze příbuznost určit porovnáním výsledků bez nutnosti dalšího testování.
Přístup ISAG je v Evropě běžnější, doporučuje jej Mezinárodní kynologická federace (FCI) a pomocí tohoto přístupu je identifikováno více markerů než přístup AKC. Přístup AKC je běžnější v Americe.
Laboratoř Genomia se pravidelně účastní srovnávacích testů kvality, které provádí každé dva roky ISAG (International Society for Animal Genetics). Níže si můžete prohlédnout nejnovější certifikát kvality, laboratoř Genomia úspěšně identifikovala 100% zavedených psích DNA markerů.
Laboratoř garantuje detekci minimálně 17 z následujících 22 markerů:
AHTk211, CXX279, REN169O18, INU055, REN54P11, INRA21, AHT137, REN169D01, AHTh260, AHTk253, INU005, INU030, amelogenin, FH2848HT121, FHHT2054, AHT162 EN04M171, AHTH247, REN23L130, REN105E03. Tyto markery jsou zařazeny do doporučeného seznamu podle Mezinárodní společnosti pro genetiku zvířat (ISAG).
PDF náhled zprávy o výsledcích.
Seznam plemen
Tato poznámka je věnována mému staršímu psovi a napsána k jejím narozeninám jako dárek. Autor se zavazuje utratit honorář způsobem přiměřeným příležitosti.
Během posledních let jsme s tímto psem – pravděpodobně ještě více, já, i když kdo ví – měli tichou soutěž o to, kdo z nás je starší. Je jasné, že bez ohledu na to, jak přepočítáte věk psa na věk člověka, dříve nebo později pes člověka předběhne. Navíc ho nyní definitivně předběhla, hlídacímu psovi bylo 13 let. Vědeckým základům takových srovnání se budeme věnovat v tomto článku.
Jak měřit dospělost
Dlouho bylo přijímáno, že jeden psí rok by se měl počítat jako sedm lidských let. Zřejmě to vychází z jednoduchého výpočtu: průměrná délka života lidí na této planetě je 70 let, průměrná délka života psa je 10 let. Ve skutečnosti už v tomto bodě může být přemýšlivý čtenář rozhořčen. Co znamená „průměrný“? Pro dobrého ovčáckého psa je 10 let doba aktivní zralosti a pro anglického mastina. nemluvme o smutných věcech. A mezi lidmi „průměr“ nic neznamená: kdo a za jakým účelem by zprůměroval například krátký život Freddieho Mercuryho s dlouhým a plodným životem Jejího Veličenstva Alžběty II., může nebe prodloužit její roky?
Asi je lepší nesrovnávat smrt, ale život. Zde je příklad: štěně začínají prořezávat zuby v 7 týdnech, dítěti v 9 měsících. Poměr 1:6. Ale puberta, tedy puberta: u psa – 10 měsíců, u teenagera zase v průměru – 12 let. Zde je faktor již 1:14.
A pokud se rozhodnete chování porovnávat, vše se stává zcela subjektivním a nevědeckým. Jaké chování by mělo být považováno za „dospělé“ a „zralé“? Když se člověk rád obléká do kostýmu kavalerie a spí se studenty, kolik je mu let? 20? 40? 60? Stejně tak váš hlídací pes, který pobíhá se špatným výrazem ve tváři a ohlodává hůl, není nutně takové dítě. Možná je to reenactor.
Věda však nestojí na místě a konečně skupina výzkumníků, většinou z Kalifornské univerzity v San Diegu, našla způsob, jak porovnat věk psa a jeho majitele, aniž by se spoléhali na vaše svévolné domněnky o tom, jak dospělý a odpovědný savec by se měl chovat.
Věková kalkulačka
Možná, že zbrklý čtenář nechce ztrácet čas vědeckým pozadím, potřebuje okamžitě spočítat věk svého psa a udělat něco zajímavějšího. Pojďme se s ním seznámit: kalkulačku najde online na tomto odkazu na webu Science. Pokud je čtenář chytrý a miluje vzorce, pak vzorec (platí pro psy staré alespoň jeden rok) vypadá takto:
“Věk psa v lidských letech” = 16 x ln(“věk psa”) + 31
Nakonec je zde praktický graf, který vám pomůže vypočítat humanizovaný věk vašeho Barbosinu.
Nyní si promluvme o vědeckých faktech, které stojí za touto hračkou.
Zářezy na genech
To, co vědci navrhli, je založeno na účinku epigenetických markerů stárnutí. Psali jsme o tom už v roce 2014 v článku „Kroky stařeny s kosou“. Bylo to takto: Steve Horvath ve vzdáleném Los Angeles se pokoušel najít nějaké znaky v lidských genech, které by určovaly, zda je vlastník těchto genů „přirozený“ nebo naopak. Téma je bolestně staré a pozoruhodně sterilní, ale Horvath si myslel, že k němu našel nový přístup: co kdybychom neporovnali samotné geny, ale „epigenetické markery“ – chemické značky připojené ke genům během vývoje organismu?
Jak by se dalo očekávat, v methylových skupinách na DNA nebylo možné najít gayness, ale bylo zjištěno něco jiného: v některých pozicích přítomnost nebo nepřítomnost známky překvapivě přesně korelovala s věkem člověka. Od té doby (a objev učinil Horvath již v roce 2011) uplynulo pod mostem hodně vody: vědec založil komerční společnost, zlepšil přesnost stanovení stáří DNA na několik měsíců a svou metodu již zavedl do forenzní věda. Jeho metoda například pomohla dostat na dlouhou dobu do vězení jistého uprchlíka, který lhal, že je nezletilý, a proto může beztrestně loupit a zabíjet.
To všechno jsou lidské záležitosti. Ukazuje se ale, že tyto „epigenetické hodiny“ fungují i u jiných savců – například u myší nebo opic. U psů také, jak o tom hovoří výše citovaný článek v BioRxiv. Vědci zkoumali metylaci genů u 104 psů ve věku od 4 týdnů do 16 let a zjistili, že mnoho genů zapojených do regulace vývoje bylo označeno methylovými skupinami na stejných místech u psů a lidí. To znamená, že je co porovnávat.
Obrázek, který se objeví, je tento: na samém začátku života začínají u psů a lidí tikat epigenetické hodiny, ale hned poté se „dospělost“ psa prudce zrychluje. Za pouhý rok pes dosáhne statusu člověka, který odpovídá „sociální vyspělosti“ – ve třiceti letech již můžete být přijati na odpovědnou pozici s podpisovým právem a pes může být přidělen do práce na policii nebo celnici. A v tomto věku pes zůstává. chtěl bych říci „na dlouhou dobu“, ale bohužel jen na více než deset let.
Ale přesto je co závidět: nejzranitelnější, ostudné a bezmocné fáze lidského života – dětství, puberta, věk přežití – pro psa rychle uletí nebo nenastanou vůbec. A téměř celý život je přesně to, co má smysl nazývat životem. Není špatné.
A pokud otočíte tento graf psí stranou nahoru, můžete položit otázku jiným způsobem: co je s námi špatně, že polovinu života trávíme tím, že se vyvíjíme, vyvíjíme se jako jednotlivci, a jakmile se vyvineme, ukáže se, že přijeli jsme. Buď je příroda nespravedlivá, nebo jsme my sami blázni.
Zbývá dodat, že existuje projekt s názvem Dog Aging Project. Začal ji Matt Kaberline ze Seattlu a může do ní přispět každý Američan, který má psa, a pokud nejste Američan, pak vám může pomoci další projekt, Darwinova archa. Zde můžete data svého psa zpřístupnit vědě, abyste porozuměli různým vědeckým otázkám. A nejen hloupé mají rády přepočítávání věku na lidské roky, ale i ty velmi důležité, například: „Proč některá plemena žijí dlouho, zatímco jiná mnohem kratší? A co by se mělo udělat pro prodloužení psích let?“ Psi na celém světě vám poděkují.
Autor je vědecký redaktor Forbes (Rusko)
